Вот и вторая часть статьи про про автономный отладчик x64dbg.
С отладчиком нужно как-то взаимодействовать: через текстовый или графический интерфейс. В "оболочке" программы с хорошо отлаженным ядром может оказаться неприятный баг, и пользователю это вряд ли понравится. Любому разработчику не хотелось бы допускать такой ситуации.