Вот например я отработал смену а в 23:40 выехал в командировку. Как считать отработанные часы?

Вообще это в корне не верно! Так как в табеле должно быть что-то одно! Но кадровики которые допускают подобное обычно предлагают вашу смену предоставить отгулом и не учитывать в этот день в табеле при этом закрывают другой день сменой, но вы в этот день в действительности отдыхаете. Так как командировка важнее и вы отсутствуете в смене по приказу о командировке! Но тут еще могут возникнуть вопросы у охраны труда, так как обычно ведется множество журналов на производстве и перед командировкой вы также проходите инструктаж в охраны труда и подписываете журнал. В общем с какой стороны не посмотри если кадровик допускает такую ситуацию это косяк который приведет к штрафам за нарушения прав работника и ведения документов учета рабочего времени.

Спасибо вам за подробный ответ. Если можно я вам в личку напишу по этому поводу?

Конечно, если вам нужна более подробная консультация, я могу помочь.