Укажите то в чем вы профи!

Стоит

Можешь указать, на собеседовании, если будет необходимо, пояснить каждый из навыков

Ну тут если в вакансии данный софт требуют то лучше его указать, но так же для правильности указать в сопроводительном скилы владения данным софтом, что при необходимости можно его подтянуть, тут важнее свою заинтересованность показать

Смотря какие задачи можешь решать этим софтом. Часто бывает такое что софтина нужна для определенной функции и вполне хватает знать ее на 5% чтобы сделать ровно то что требуется и идти дальше. Взять тот же Эксель например. 99% юзеров используют его навряд ли больше 1-3% всего того мощнейшего функционала, который там заложен.

Если есть возможность продемонстрировать что-либо, не нарушая общего впечатления, то, полагаю, стоит это сделать.

как вариант написать на каждый софт уровень владения

Ведь получается что вроде как  знаком с программой, но полноценно же в ней работать не можешь.