Вопросы мотивации достаточно сложны и на мой взгляд не существует идеальных решений на все случаи жизни. Многое зависит от специфики отрасли, компании, отдела, культуры, целей, которые хотим достигнуть. Где-то лучше работает одна схема а где-то другая, например, что хорошо для отдела продаж не подходит для бухгалтерии. Вы правы что часто бонусная система не работает или даже наоборот приносит вред, но это значит что руководство не достаточно внимательно к этому вопросу, не оценивает эффективность системы, не вносит изменений. Очень сложно разработать эффективную систему сидя в кабинетах, надо пробовать внедрять, не бояться экспериментировать и конечно анализировать получаемые результаты.