Потому что на момент адаптации сотрудник не выдает свою финансовую продуктивность и, соответственно, долю денег в компанию он не заработал, из которой ему будет выплачено его вознаграждение. Кратко: пользы пока нет, а за что тогда платить?

Экономия, плюс возможность как то затянуть испытательный срок, так как за 3 месяца в некоторых профессиях невозможно определить КПД сотрудника. Зелёный он ещё: и вроде бы часть тянет, а остальное нет. А решение пора принимать - прошёл испытательный или нет.

p.s. Вчера читал новость о законодательном закреплении понятия стажер и возможность стажировки до полугода.

Банальная попытка сэкономить, сделать кусок работы, потом не взять человека под разными предлогами.